通天教主率领截教众仙来到了万仙阵前，准备与老子等人一决高下。老子嘲讽通天教主说：“今日就与你决定雌雄，你的万仙遭难，正是你反复不定的罪责所致。”通天教主大怒，催动奎牛，挥剑向老子砍去。老子则催动青牛，举起扁拐迎战。
元始天尊对左右的门人说：“今日你们都要全力以赴，一起进入万仙阵中，与截教万仙交战，不得错过这个机会。”众门人听后士气高涨，呐喊着齐刷刷地杀入万仙阵中。
文殊广法天尊骑着狮子，普贤真人骑着白象，慈航道人骑着金毛犼，三位大士各自现出化身，勇猛地冲进阵中。灵宝大法师仗剑而来，太乙真人手持宝锉也进入阵中助战。衢留孙、黄龙真人、云中子、燃灯道人等也紧随其后，一起杀向万仙阵。
姜子牙和哪吒等众门人也不甘示弱，大声呼喊着：“我们今天一定要破这万仙阵，看看谁是真正的胜负！”他们的话音未落，只见陆压道人从空中飞来，也冲进了万仙阵内助战。
老子与元始天尊一同冲入万仙阵内，与通天教主展开了激战。金灵圣母则被文殊广法天尊、普贤真人和慈航道人这三位大士围攻。三位大士化身多头多臂的神通形态，浑身上下都闪耀着金灯、白莲、宝珠等光华，显得异常神圣而强大。
金灵圣母奋力抵挡三位大士的攻击，但终究不敌他们的神通广大。在激烈的战斗中，她的金冠脱落，头发散乱，但她仍然披发大战，毫不退缩。然而，就在她全力应对三位大士的时候，燃灯道人突然祭起定海珠打来，正中她的顶门。金灵圣母就这样被定海珠打死，封神正位为星首，她的存在也将在北阙香烟中万载留存。
与此同时，广成子、赤精子、道行天尊和玉鼎真人分别祭起诛仙四剑，数道黑气冲空而起，将万仙阵笼罩其中。凡是在封神台上有名之人，都如同砍瓜切菜一般被轻易斩杀。姜子牙也祭起打神鞭，在万仙阵中任意施为，威力无穷。杨任则用五火扇扇起烈火，千丈黑烟弥漫整个战场，使得万仙阵中的截教门人更加难以抵挡。
哪吒也展现出三首八臂的神通形态，在战场上往来冲突，勇猛无比。玉虚宫门下的众弟子也如同狮子摇头、狻猊舞势一般奋勇杀敌，只杀得山崩地塌、日月无光。
通天教主眼见自己的门人弟子在万仙阵中遭受如此惨重的损失，心中大怒。他急忙呼喊长耳定光仙取来六魂幡，想要扭转战局。然而长耳定光仙在看到接引道人等西方教弟子的神圣气象后心生畏惧和犹豫，他知道截教毕竟差了一些什么。于是他将六魂幡收起并轻轻走出万仙阵，径直前往芦篷下隐匿起来。
通天教主大呼：“定光仙，快拿幡来！”他连喊数声，但定光仙却已不见踪影。教主立刻明白定光仙已经背叛，心中大怒。他也无心恋战，但看到万仙遭受如此狼狈，又怎能置身事外？想要上前助战，却被四位教主阻拦；想要退后，又恐被教下门人笑话。通天教主只得勉强相持，却又被老子打了一拐。
通天教主情急之下，祭起紫电锤来打老子。然而，老子头顶现出玲珑宝塔，紫电锤根本无法近身。通天教主正出神之际，不妨元始天尊又一如意打中他的肩窝，几乎将他从奎牛上打下。通天教主大怒，奋勇争战。
此时，二十八宿星官已经杀得所剩无几。丘引见势不妙，想要借土遁逃走，却被陆压看见。陆压唯恐追不上，急忙纵身至空中，将葫芦揭开，放出一道白光。白光中飞出一物，陆压命令道：“宝贝转身！”可怜丘引的头颅已经落地。陆压收了宝贝，再次回到阵中助战。
与此同时，接引道人在万仙阵内打开乾坤袋，将那些有缘前往极乐之乡的三千红气之客全部收入袋中。这些被收入袋内的人都是有缘人，他们将被接引道人带往极乐世界，享受永恒的福乐。
准提道人同孔雀明王在万仙阵中展现神通，现出三十四头、十八只手的法身，手持各种法器，与通天教主激战。通天教主看见准提道人，怒火中烧，大骂对方欺人太甚，纵奎牛冲来，挥剑直取。然而，准提道人用七宝妙树轻轻一刷，便将通天教主手中的剑打得粉碎。通天教主见状，只得拎起奎牛，跳出阵去。准提道人收了法身，老子与元始天尊也没有追赶。
随着万仙阵的破灭，群仙鸣动金钟、击响玉磬，纷纷回到芦篷上。老子与元始天尊看见定光仙躲在芦篷下，便问其缘由。定光仙拜伏在地，坦诚交代了自己藏匿六魂幡的原因。他表示，虽然身为截教门人，但见师伯们道正理明，而通天教主却偏听逆理、造下业障。他实在不忍使用六魂幡伤害二位师伯及西方教主、武王、子牙等人，因此才将六魂幡收起并藏身于此。
元始天尊听后赞叹定光仙是有根器之人，并命他跟上芦篷。四位教主坐下后共论今日邪正方分。老子要求定光仙取出六魂幡来看看，定光仙依言将幡呈上。西方教主建议摘去周武王和姜尚的名讳后将幡展开以测试他们的根行如何。准提道人随即摘去二人名讳并命定光仙展布六魂幡。然而连续展动数次后四位教主顶上各现奇珍保护其身毫发无损。
定光仙见状大惊失色并弃幡倒身下拜感慨自己师父妄动嗔念陷害了无数生灵。西方教主则趁机向他传授了一偈语并邀请他日后有幸加入沙门修行。这段偈语寓意着极乐世界的美妙景象以及修行的种种好处让定光仙心生向往之情。
接引道人和准提道人说道：“定光仙与我们西方教有缘。”元始天尊也点头表示同意：“他今日能来到这里，说明他已经有了弃邪归正的念头，理应皈依到你们门下。”于是，定光仙便拜了接引道人和准提道人为师。
姜子牙在芦篷下与哪吒等人谈论今日万仙阵中的情况，感叹许多道者无辜受戮，心中十分痛心。但门下弟子们却个个欢喜，因为他们知道这是正义的胜利。
与此同时，通天教主在万仙阵被破后，领着二三百名散仙逃到一座山下暂时休息。他心中愤恨难平，自思道：“定光仙这个可恨的家伙，竟然将六魂幡窃去，让我大功不能成！这次失利，我还有何颜面再掌管碧游宫大教呢？”他左思右想，决定一不做二不休，回宫后再立地水火风，换个世界重新开始。左右的众仙也都纷纷表示赞同。
然而，通天教主又看到自己左右四个亲信门徒都已经丧命，心中更是切齿深恨。他想：“不如先去紫霄宫见我的老师，向他禀报此事，然后再行动。”于是，通天教主便带着满腔的怒火和不甘，前往紫霄宫而去。
正当通天教主与众散仙商议时，忽然看见正南方祥云万道，瑞气千条，异香扑鼻。一道者手执竹杖而来，原来是鸿钧道人。通天教主知道自己的师尊来了，慌忙上前迎接，倒身下拜，并祝愿老师圣寿无疆。他解释自己设下万仙阵是因为两位师兄欺压自己，但鸿钧道人却责备他自己作孽，导致生灵涂炭。
鸿钧道人提醒通天教主，三教共同签署了封神榜，不应该为小事生气。他批评通天教主作为混元大罗金仙和三教元首，却因为小事生气，做出过恶。虽然这是劫数，但也是因为通天教主约束不严，门徒生事。鸿钧道人表示自己来是为了解释冤仇，让各人掌管自己的教宗，不再生事。他命令左右散仙各自回到洞府，等待超脱。
鸿钧道人随后让通天教主先到芦篷通报。通天教主虽然心中不愿意，但也不敢违抗师命。他来到芦篷下，心中自思如何面对老子和元始天尊。此时，哪吒和韦护等人正在芦篷下议论万仙阵中的情况。他们看到通天教主和一个老道人一起走来，都感到惊疑不定。通天教主走近芦篷后，大声呼叫哪吒去报告老子和元始天尊来接驾。哪吒随即上篷报告。
话说老子正在芦篷上与西方教主讨论弟子们的劫数之厄如今已经圆满，突然抬头看见祥光瑞霭腾腾而来。老子知道是老师鸿钧道人来了，于是急忙起身告诉元始天尊。两人率领众弟子下篷迎接。哪吒前来报告说通天教主跟着一个老道人来了，呼叫老爷接驾，不知道是什么原因。老子告诉哪吒，这是他们的老师鸿钧道人，想必是来此为他们解释冤仇的。
于是，老子、元始天尊等人一同下篷迎接，俯伏在道旁，请求鸿钧道人恕罪。鸿钧道人告诉他们，他此次前来是因为十二代弟子运逢杀劫，导致两教不和。他特地来解释过错，希望各人能够各自安守宗教，不要再自相背逆。老子和元始天尊都表示听从老师的命令。
接着，鸿钧道人上到芦篷上与西方教主相见，并称赞西方极乐世界是福地。西方教主谦虚回应。然后，鸿钧道人让老子、元始天尊和通天教主过来，对他们说：“你们三个共立封神榜，以观众仙的根行深浅。但现在通天弟子轻信门徒，导致事端频发。虽然是劫数难逃，但终究是因为你不守清净，自背盟言，不能善为众仙解脱，才使得他们遭受屠戮。罪过确实在你，并非我作为老师有所偏向，这是公论。”接引道人和准提道人都表示老师的话没有错。
鸿钧道人接着说：“今天我跟你们讲明白，从此解释清楚。大徒弟，你要让过他吧。你们都各自回归山林，不要再伤害生灵了。况且众弟子的厄运已满，姜尚的大功即将完成，再多说也无益。从此你们各自修行自己的宗教吧。”说完，鸿钧道人让三位教主过来跪下，并从袖子里取出一个葫芦，倒出三粒丹药来，每位赐一粒：“你们吞入腹中，我自有话说。”三位教主都依照老师的命令吞下了丹药。
鸿钧道人告诉他们：“此丹并非治病长生之物，你们听我说来。此丹炼就有玄功，因你们三人各自有心结。如果谁先改变念头，腹中的丹药就会立刻发作，让他丧命！”这是鸿钧道人为了确保三位教主不再争斗，而给他们的一个严厉警告。
鸿钧道人作完诗后，三位教主都磕头感谢老师的慈悲。鸿钧道人起身告别西方教主，命令通天教主随他一同离去。通天教主不敢违抗师命。接引道人和准提道人也都起身，与老子、元始天尊以及众门人一起送到芦篷下。鸿钧道人与西方两位教主告别后，老子与众门人等又拜伏在路旁，等待鸿钧道人启程。鸿钧道人吩咐众人各自回去，于是众人都起立拱手等候。只见鸿钧道人与通天教主驾着祥云缓缓离去，西方教主也告辞回西方去了。
老子、元始天尊对姜子牙说：“今日我等与十二代弟子都回洞府去了，等待你封过神后，再重新修炼身命，才能成为真仙。”这正是：“重修顶上三花现，返本还云又是仙。”姜子牙与元始天尊等众仙下了芦篷，姜子牙伏在路旁，拜求掌教师尊说：“弟子姜尚蒙受师尊指示，得以进到这里，不知道以后与诸侯相会的事情会如何？”老子说：“我有一首诗，你牢记在心，自有应验。诗曰：‘险处又逢险处过，前程不必问如何。诸侯八百看看会，只待封神奏凯歌。’”老子说完，与元始天尊各自回玉京去了。
广成子与十二代仙人都来告别姜子牙说：“子牙，我们与你这一别，恐怕再也难以见面了！”姜子牙心中十分不忍分离，在芦篷下恋恋不舍。姜子牙作诗送别他们，诗曰：“东进临潼会万仙，依依回首甚相怜。从今别后何年会？安得相逢诉旧缘。”众仙告别离去后，只有陆压握着姜子牙的手说：“我们此去，恐怕再难相见了。前途虽然有凶险之处，但都有解释之人相助。只是还有几件难办的事情，非此宝不可。我将这个葫芦之宝送给你，以备后用。”姜子牙感激不已。陆压随即将飞刀交给姜子牙，也自行告别离去了。
故事分两头进行，一头讲述元始天尊回到玉虚宫的情况。申公豹因为破了万仙阵，原想逃窜到其他山头，但恶行已满，终被追捕。他骑着虎逃跑，但白鹤童子看见他在前面飞驰，就像飞云掣电一般。白鹤童子急忙告诉元始天尊：“前面是申公豹在逃窜。”元始天尊说：“他曾发誓，现在命黄巾力士用我的三宝玉如意把他捉到麒麟崖等候。”童子接过如意，递给力士。力士追上去，大喊：“申公豹，不要走！奉天尊法旨，捉你去麒麟崖听候！”他祭起如意，凭空将申公豹捉拿到麒麟崖。
元始天尊驾临崖前，落下九龙沉香辇，看见黄巾力士将申公豹带来，放在他面前。元始天尊说：“你曾发誓要去塞北海眼，今天你无话可说。”申公豹低头不语。元始天尊命令黄巾力士：“将我的蒲团卷起来，把他拿去塞了北海眼！”力士遵命将申公豹塞进了北海眼。
另一头，姜子牙带领众门徒回到潼关见武王。武王说：“相父今天回来，兵士都齐备了，可以迅速进兵，早日与诸侯会合，是我的幸运。”姜子牙传令起兵前往临潼关。只走了八十里，就已经来到关下，安下行营。
临潼关的守将欧阳淳听闻报告后，与副将卞金龙、桂天禄、公孙铎商议说：“现在姜子牙带兵来攻，我们只有一道关卡，怎么能阻挡周兵呢？”众将说：“主将明天与周兵交战一场，如果能胜就以胜势退周兵；如果不能胜，然后坚守关卡，修表往朝歌去告急，等待援兵协守，这是上策。”欧阳淳说：“将军们说得对。”于是，一场关乎临潼关存亡的战斗即将展开。
第二天，姜子牙升帐发令：“谁愿意去取临潼关？”旁边的黄飞虎说：“我愿意前往。”姜子牙同意了。黄飞虎带领本部人马，一声炮响后，至关下挑战。探马回报到帅府：“报告主帅，有周朝将领挑战。”欧阳淳问：“谁去迎战？”先行官卞金龙领令出关，见到黄飞虎后大喊：“来将何名？”黄飞虎回答：“我是武成王黄飞虎。”卞金龙大骂：“反贼不思报国，反而助纣为虐！我是临潼关先行卞金龙。”两人随即交战，但不到三十回合，黄飞虎就使了个破绽，将卞金龙刺下马来，割下首级，然后鸣鼓回营，向姜子牙报功。
探马将战况报入帅府，欧阳淳大惊。卞金龙的家将也将消息报回本府，卞金龙的妻子胥氏听说后放声大哭。这哭声惊动了后园的长子卞吉。卞吉问左右：“母亲为何哭泣？”左右将卞金龙阵亡的事情告诉了他。卞吉怒发冲冠，随即换了披挂，来见母亲说：“母亲不必哭泣，待我为父亲报仇。”但胥氏只是继续哭泣，没有理会卞吉。
卞吉上马来到帅府前，左右报入殿庭：“启禀元帅，卞先行的长子前来听令。”欧阳淳命令他进来。卞吉上殿行礼后，含泪问：“我的父亲死在何人之手？”欧阳淳回答：“令尊不幸被反贼黄飞虎枪挑下马，丧了性命。”卞吉说：“今天天色已晚，明日我定要拿仇人为父亲泄恨。”
卞吉回到家中后，命令家将扛抬一个红柜跟随他出关。他率领军士来到关外后竖起一根大幡杆，并打开红柜取出一面幡挂起来悬在空中四五丈高。
当日，卞吉竖起幡杆后，单枪匹马直闯周营辕门挑战。哨马迅速报入中军：“启禀元帅，关内有将请战。”姜子牙问：“谁人出马迎战？”南宫适领命出营。他见一员小将面貌凶恶，手持方天画戟，大声呼喝：“来者何人？”南宫适笑道：“似你这等黄口小儿，定然不认得我是西岐大将南宫适！”卞吉回应：“我今日且饶你一死，回去只叫黄飞虎出来！他杀我父亲，我与他有着不共戴天之仇。我不拿你这等替死之辈出气。”南宫适听后大怒，纵马舞刀直取卞吉，两人开始交战。
卞吉与南宫适的战斗异常激烈，棋逢对手，将遇良才。他们大战了二三十回合后，卞吉突然拨马便走，南宫适紧追不舍。卞吉先往幡下过去，南宫适不知其中奥妙，也跟着往幡下冲来。结果马到幡前时，南宫适连人带马跌倒在地，不省人事。守幡的军士迅速上前将南宫适用绳索绑住并抬出幡外。南宫适这才睁开眼睛苏醒过来，意识到自己中了对方的左道之术。
卞吉进关向欧阳淳报告了擒获南宫适的经过。欧阳淳命令将南宫适推至殿前审问。南宫适站立不跪，表现出坚定的气节。欧阳淳大骂：“反国逆贼，今已被擒，还敢如此无礼！”他随即下令将南宫适速斩首级以儆效尤。然而旁边的公孙铎提出了不同意见：“主将在上，当前奸佞当道，他们诬陷我等守关将士都是虚报战功、冒领军饷。依末将之见，不如将南宫适暂时关押起来等待捉获其他反贼首领后再一起解往朝歌交差。这样可以堵住那些奸佞之口并证明我们边关将士并非冒领虚报之人。”欧阳淳觉得公孙铎的建议很合自己心意于是便采纳了并将南宫适送入监牢中看管起来。
姜子牙听说南宫适被擒后，心中非常惊慌，闷闷不乐地坐在中军帐中。第二天，卞吉又来挑战，并点名要黄飞虎出战。黄飞虎带着黄明和周纪出营迎战。双方交锋不久，卞吉就假装战败，退到幡下。黄飞虎不知是计，紧追不舍，结果也被擒获。黄明见状大怒，冲上前去想要救出黄飞虎，但同样在幡下被擒。
卞吉连续擒获两名周将后，进关向欧阳淳报功，并要求将黄飞虎斩首以报父仇。然而，欧阳淳认为黄飞虎是起义的主谋，应该将他献给朝廷正法，这样既能泄恨又能显功。于是决定将黄飞虎暂时关押起来。
周纪见黄明也失利后，不敢再贸然进攻，只好败退回营向姜子牙报告情况。姜子牙听说黄飞虎被擒后大惊失色，并询问周纪详细经过。周纪描述了幡的情况以及黄飞虎和黄明被擒的经过。姜子牙听后确认这是左道之术，并决定次日亲自出战查看究竟。
第二天，姜子牙带领众将和门人出营查看幡的情况。他们发现这幡高悬空中，散发着千条黑气和万道寒烟。哪吒等人仔细观察后发现白骨上都有朱砂符印。姜子牙确认这是左道之术，并告诫众人交战时不要从幡下经过。
此时，报马进入关内向欧阳淳报告情况。欧阳淳也亲自出关来会姜子牙。他并没有从幡下经过，而是绕到旁边走来。姜子牙看见后对自己的门人说：“你们看主将也不从这里过。”众将都点头表示理解。
姜子牙迎上前去与欧阳淳对话，并试图说服他归顺天命。然而欧阳淳大怒并命令卞吉拿下姜子牙。卞吉催马摇戟冲上前来，但被雷震子拦住去路。两人交战数合后，卞吉假装败退并引诱雷震子攻击妖幡。然而雷震子被妖气迷住并昏迷不醒，结果被守幡的家将捆绑起来。
韦护也出手攻击，祭出自己的降魔杵，韦护看到降魔杵竟然落在幡下，不觉大惊失色。众门人也都彼此对望，感到惊异。这时，卞吉再次冲到军前，大声呼喊道：“姜尚，你早早下马投降，还能免你一死！”哪吒听后勃然大怒，他登开风火轮，现出三首八臂的法身，大喝道：“你这匹夫，休得猖狂！”然后摇着火尖枪直冲卞吉而去。卞吉见哪吒如此威猛，先自吃了一惊。两人交战不到两个回合，哪吒就用乾坤圈将卞吉几乎打下马来，卞吉只好回身败逃进关去了。
在姜子牙的后方，李靖催马摇戟前来助战。欧阳淳旁边有桂天禄挥舞手中刀来抵挡李靖。但两人交战不久，桂天禄就被李靖一戟刺于马下。欧阳淳见状大怒，他亲自摇着手中斧来战李靖。姜子牙命令左右擂鼓助战，周军士气大振。
此时，只见阵后冲出辛甲、辛免、毛公遂、周公旦、召公奭等无数周将，他们一起将欧阳淳围在当中。周纪、龙环、吴谦三将也前来助战，使得欧阳淳只有招架之功，更无还手之力。